V primerjavi z zobno nitko in zobotrebcem, ima medzobna ščetka najboljši dostop do  vseh težje dostopnih mest - predvsem pri kočnikih, kjer je prerez stičnih ploskev med sosednjima zoboma oblikovan konkavno.

Iz medzobnih prostorov, še posebej kjer so konkavnega prereza, lahko plak temeljito očistimo le z medzobnimi ščetkami. Te so zelo uporabne tudi pri čiščenju okrog mostičkov, implantatov, fiksnega ortodontskega aparata in po operacijah dlesni.

Ščetine naj bodo čim tanjše, da dosežejo vsa težje dostopna mesta ob zobeh. Žica na sredini ščetke naj ne bo predebela, da lahko brez težav preide v medzobni prostor in ob tem ne povzroči poškodb.

Izbira primerne velikosti medzobnih ščetk

Zelo pomembno je, da uporabljamo medzobno ščetko pravilne velikosti, saj premajhna ne očisti dovolj temeljito, prevelika pa lahko poškoduje dlesen. Pravilno velikost medzobne ščetke nam lahko določi zobozdravnik ali ustni higienik z uporabo IAP barvne sonde. V kolikor ta možnost ni na voljo, določimo ustrezno velikost tako, da poskušamo z večimi različno velikimi medzobnimi ščetkami po vrsti od največje k manjšim.

V primeru, da medzobnih prostorov do zdaj niste čistili, obstaja velika možnost, da je dlesen v medzobnih prostorih rahlo vneta in bo ob prvem čiščenju z medzobno ščetko zakrvavela.

 Ta krvavitev bo po nekajkratnem čiščenju prenehala, dlesen bo rahlo uplahnila in medzobni prostor se bo morda malo povečal, zato je treba ponovno preveriti ustreznost izbire velikosti medzobnih ščetk za posamezne medzobne prostore.